Pondok Pesantren selain memiliki tujuan untuk mengajarkan ilmu agama, juga memiliki visi untuk membentuk karakter dari santri yang sedang menimba ilmu. Pondok Pesantren Pangeran Diponegoro merupakan pilihan yang baik, karena menggabungkan sistem pesantren salaf dan pendidikan formal dengan sistem pendidikan modern, sehingga siswa atau santri dapat mendapatkan pendidikan agama sekaligus pendidikan umum.